Постановление Правительства Российской федерации «О создании аварийно-технических центров для ликвидации чрезвычайных ситуаций на объектах ядерного комплекса Российской Федерации» от 25 марта 1993 г. № 246 послужило дальнейшему развитию отраслевой системы предупреждения и ликвидации последствий аварий на предприятиях Министерства РФ по атомной энергии. Во исполнение этого документа в пяти регионах Российской Федерации были созданы аварийно-технические центры.

Аварийно-технический центр в Нововоронеже, специализирующийся на оказании помощи при отклонениях от нормальных режимов эксплуатации атомных станций и исследовательских реакторов России, был учрежден как филиал ФГУП Концерн «Росэнергоатом» приказом № 82 от 22 сентября 1993 года.

С целью оптимизации структуры аварийно-спасательной службы Госкорпорации «Росатом» в 2008 году — преобразован в филиал Федерального государственного унитарного предприятия «Аварийно-технический центр Минатома России» (г. Санкт-Петербург).